อยู่ๆ ในญี่ปุ่นก็เกิดคดีประหลาด เมื่อเหล่าอาชญากรต่างล้มตายเป็นใบไม้ร่วง ด้วยสาเหตุเดียวกันนั้น คืออาการหัวใจวาย - ผู้คนต่างยกย่องผู้พิพากษาชีวิตฆาตกรเหล่านั้น ว่าเป็นพระเจ้าผู้พิทักษ์ความถูกต้อง และเรียกเขาว่า Kira (คิระ = Killer) คดีคิระกลายเป็นคดีที่ทำให้กรมตำรวจญี่ปุ่นปวดหัวที่สุด เพราะเป็นคดีฆาตกรรมที่ฆาตกร ไม่เคยทิ้งร่องรอยในการฆ่าเอาไว้เลย…

ยางามิ ไลท์ (ทัตซึยะ ฟูจิวาระ) นักเรียนอัจฉริยะเจ้าของคะแนนสอบอันดับ 1 ของประเทศ ประกาศตัวเป็นคนหนึ่งที่เห็นด้วยกับการกระทำของคิระ แม้ว่าเขาจะเป็นลูกชายของนายตำรวจผู้รับชอบคดีนี้ก็ตาม... ไลท์เชื่อแนวคิดที่ว่า ในเมื่อกฎหมายไม่สามารถจัดการคนทำผิดได้ เราก็ต้องใช้วิธีอื่นจัดการคนเหล่านั้น

จากเด็กหนุ่มผุ้มุ่งมั่นจะเดินตามรอยเท้าพ่อ ด้วยการเป็นตำรวจนักสืบอันดับ 1 ของประเทศ! จนกระทั่ง เขาใช้ความเป็นอัจฉริยะของตัวเองแฮคข้อมูลในกรมตำรวจ และพบว่ามีคดีอาชญากรรมนับพันคดี ที่ไม่สามารถพิพากษาคนผิดได้ และท่ามกลางความจริงที่สั่นคลอนศรัทธาต่อความยุติธรรม อาจจะเป็นสวรรค์หรือนรกก็ได้ ที่ลิขิตให้เขาได้เจอสมุดโน้ตเล่มหนึ่ง

วิธีใช้ Death Note ก็คือ เขียนชื่อ–สกุล ของคนที่ต้องการฆ่า ลงใน Death Note โดยผู้เขียนจะต้องรู้จักหน้าตาของผู้คนๆ นั้น Death Note ถึงจะส่งผลให้คนผู้นั้นตายภายใน 40 วินาที ซึ่งถ้าไม่ระบุสาเหตุการตาย คนๆ นั้นจะตายด้วยอาการหัวใจวาย

หลังจากที่ไลท์เก็บ Death Note ได้ เขาก็ใช้มันฆ่าอาชญากรทีละคน จากข้อมูลที่เขาเก็บไว้ และสร้างรูปแบบของคดีฆาตกรรมคิระขึ้น เพื่อปั่นหัวกรมตำรวจ

จากความซับซ้อนของคดีคิระ องค์กรตำรวจลับของโลก ได้ส่ง L (เคนอิชิ มัตสึยามะ) มาคลี่คลายคดี เพราะเขาได้ชื่อว่าเป็นนักสืบอัจฉริยะ ที่ไม่เคยคลี่คลายคดีไม่ได้ L ตรวจสอบจากรูปแบบการฆ่า จนรู้ว่าฆาตกรอยู่ที่ญี่ปุ่น เป็นเด็กมัธยม และเป็นคนใกล้ชิดกับตำรวจ เขาจึงส่ง FBI เรื่องนี้อย่างลับๆ แต่เรื่องกลับกลายเป็นว่า FBI ที่ถูกส่งเข้ามาทุกคนถูกฆ่าตาย การตายของ FBI ทำให้ L สงสัย ยางามิ ไลท์ จนถึงขนาดติดกล้องสอดแนมจำนวน 67 ตัวไว้ในห้องนอนไลท์ เพื่อสอดแนมพฤติกรรม แต่กล้องสอดแนมจำนวน 67 ตัวก็ยังคงทำอะไรไลท์ไม่ได้ เมื่อเขายังคงสร้างรูปแบบฆาตกรรมให้ดำเนินต่อไปได้ แม้จะถูกจับตามองอย่างใกล้ชิด

L ท้าทายไลท์หลายอย่าง แต่ทุกครั้งก็ไม่เคยต้อนให้ไลท์จนมุมได้ จนกระทั่งเกิดคดี 'ชิโอริ' ขึ้น

อาคิโนะ ชิโอริ (ยูคาชิอิ) คือ แฟนของไลท์ ที่ถูกคู่หมั้นของ FBI ที่ติดตามไลท์จับไป เพื่อบีบคั้นให้ไลท์ยอมรับว่า แท้จริงแล้ว ไลท์ ก็คือ คิระ